電子肛腸鏡和普通肛腸鏡的主要區別就在于普通的肛腸鏡一般不帶有光源，另外也不會在屏幕上進行成像，一般是通過肉眼進行觀察。而電子肛腸鏡將先進的醫用視頻、攝像技術完整結合，其智能檢查：數字彩屏顯示，圖像可固定、儲存、再現，可用于治療前后對比，彩色打印結果、病歷管理、查詢等。對各種肛腸疾病的診斷和治療有著決定性的作用。不管是普通肛腸鏡還是電子肛腸鏡都需要有經驗的醫師去解讀，無論是普通的肛腸鏡還是電子肛腸鏡，在檢查之前都要排空大便保持肛管直腸內的空虛。另外就是要注意保持肛門局部的清潔衛生，都有利于局部的檢查，避免出現疾病的遺漏。
